•가장 중요한 부작용은 무과립구증(agranulocytosis)으로서 발열, 인후통, 구내염이 나타나면 즉시 보고해야 하며, 이를 예방하기 위해 정기적인 전혈검사(CBC)가 필요하다.
•항갑상샘제는 평생 복용하는 약물은 아니며 빨대는 치아착색 부작용이 있는 Lugol solution(SSKI) 복용 시 사용한다. 격리는 방사성요오드 치료 시 적용한다. 메티마졸보다 태아기형 위험이 낮아 임신 시 중단하지는 않으며 장기 복용 시 간독성 우려가 있어 임신 중기 이후에 교체를 고려하기도 한다.