임신 중 항갑상선제 선택은 삼분기별 기형 유발성으로 결정. Methimazole은 태반 통과·1삼분기 사용 시 embryopathy(aplasia cutis·choanal atresia·esophageal atresia·omphalocele) 연관. PTU는 1삼분기에 기형 위험이 낮아 선호되지만 중증 간독성 비율이 더 높다. 표준 접근: (1) 임신 전 또는 가능한 한 일찍 PTU로 변경, (2) 1삼분기 내내 PTU 유지, (3) 2삼분기 시작 시 methimazole로 다시 전환하여 잔여 임신 기간의 간독성 노출 최소화, (4) 태아 갑상선기능저하 회피 위해 free T4를 정상 상한 부근에 유지하는 최저 용량 사용, (5) 방사성 요오드 절대 금기·고용량 요오드 보충 회피·갑상선 절제는 특별한 경우에만, (6) 산모 TSH/free T4 4주마다 모니터·태아 갑상선 초음파 주기적 고려. 모든 약 중단은 thyroid storm과 유산 위험. 요오드 부하는 호르몬을 일시 억제하지만 Wolff-Chaikoff에서 탈출하여 질환을 악화시킬 수 있다.
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