기능별 조직은 구급, 화재 진압, 구조, 지휘 등 업무 성격에 따라 부서를 나누어 각 부서가 전문 기능에 집중하도록 설계된 구조이다. 다중 출동 현장에서는 각 기능의 전문성이 환자 예후에 직접적인 영향을 미친다.
기능별 조직의 최대 장점은 유사 업무와 전문성을 가진 인력이 한 부서에 모여 업무 숙련도와 전문성이 향상된다는 점이다. 예를 들어 구급대원은 전문심장소생술에, 구조대원은 차량 문 개방 등 고유 기술에 집중함으로써 전체 대응 효율이 높아진다.
기능별 조직은 부서 간 협력 부족과 부서 목표가 조직 전체 목표보다 우선시되는 부분 최적화 위험이 있다. 현장에서는 통합 지휘 체계를 통해 기능 간 조정과 정보 공유를 보완해야 한다.
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