핵심 해설
이 문제는
대장균(E. coli)의 DNA 복제 과정 중
지연가닥(Lagging strand) 합성의 마무리 단계를 묻고 있어요. 지연가닥은 불연속적으로 합성되므로 여러 개의
오카자키 절편(Okazaki fragment)이 만들어지고, 이 절편들 사이에 있는 RNA 프라이머(Primer)를 제거하고 DNA로 채워 넣어야 연결이 완성됩니다. 이 과정에서 핵심적인 역할을 하는 효소가 바로
DNA 중합효소 I(DNA Polymerase I)이에요.
핵심 개념 분석 (Key Concept): DNA 중합효소 I은 하나의 효소에 두 가지 중요한 활성이 있어요. 바로
핵심! 5'→3' 엑소뉴클레아제 활성(5'→3' Exonuclease activity)과
5'→3' 중합효소 활성(5'→3' Polymerase activity)입니다. 이 두 활성 덕분에 RNA 프라이머를 앞에서 깎아내며 동시에 그 자리를 DNA로 채우는 연속적인 작업이 가능해요. 이 현상을
닉 트랜슬레이션(Nick translation)이라고 합니다.
정답 근거 (Answer Rationale):
3번 선택지가 옳습니다. DNA 중합효소 I은 5'→3' 엑소뉴클레아제 활성으로 RNA 프라이머를
5'→3' 방향으로 제거하고, 동시에 5'→3' 중합효소 활성으로 그 빈자리를 DNA로 채워 넣습니다. 모든 DNA 중합효소는 새 가닥을 합성할 때 주형(Template)을 읽는 방향과 반대인 5'→3' 방향으로만 뉴클레오타이드를 추가할 수 있어요.
오답 분석 (Distractor Analysis):
혼동 주의! 1번 선택지는 DNA 중합효소 I의 DNA 채워 넣기 방향을 "3'→5'"로 잘못 기술했어요. DNA 합성은 오직 5'→3' 방향으로만 진행됩니다.
혼동 주의! 2번 선택지는 RNA 프라이머 제거 방향을 "3'→5'"로, DNA 채워 넣기 방향을 "3'→5'"으로 모두 잘못 기술했습니다. DNA 중합효소 I의 엑소뉴클레아제 활성은 5'→3' 방향입니다.
4번 선택지는
DNA 중합효소 II(DNA Polymerase II)가 이 역할을 한다고 잘못 기술했어요. DNA 중합효소 II는 주로 DNA 손상 복구(DNA repair)에 관여하며, 오카자키 절편의 성숙에는 관여하지 않습니다.
혼동 주의! 5번 선택지는 대장균에서
RNase H가 주된 프라이머 제거 효소인 것처럼 설명했지만, 대장균에서 이 역할의 주체는 DNA 중합효소 I입니다. RNase H는 진핵생물(Eukaryote)에서 오카자키 절편의 RNA 프라이머를 제거할 때 더 중요한 역할을 합니다.
연관 개념 정리 (Related Concepts): DNA 중합효소 III는 오카자키 절편을 신장시키는 주요 효소이고, DNA 중합효소 I은 프라이머 제거와 갭 채우기, DNA 리가아제(Ligase)는 최종적으로 절편들을 연결합니다. 각 효소의 작용 방향성(5'→3')을 정확히 이해하는 것이 매우 중요해요.
개념 정리: 대장균 DNA 복제 효소의 역할
| 효소 | 주요 기능 | 핵심 활성 방향 |
|---|
| DNA 중합효소 III | 주요 DNA 신장 효소 (선도/지연가닥) | 5'→3' 중합, 3'→5' 교정 |
| DNA 중합효소 I | 프라이머 제거 및 갭 채우기 (닉 트랜슬레이션) | 5'→3' 중합, 3'→5' 교정, 5'→3' 엑소 |
| 프리마아제(Primase) | RNA 프라이머 합성 | 5'→3' (RNA 중합) |
| DNA 리가아제 | 오카자키 절편 사이의 골격 연결 | - |
한눈에 비교!: 원핵세포(Prokaryote) vs 진핵세포(Eukaryote)의 지연가닥 성숙
| 구분 | 원핵세포 (예: 대장균) | 진핵세포 (예: 인간) |
|---|
| 프라이머 제거 효소 | DNA 중합효소 I (5'→3' 엑소 활성) | RNase H (주로), FEN1 |
| 갭 채우기 효소 | DNA 중합효소 I | DNA 중합효소 δ (델타) |
| 연결 효소 | DNA 리가아제 | DNA 리가아제 I |
암기 팁: "모든 DNA 합성은 5'→3'이다!"라고 외우세요. DNA 중합효소 I은 "깎으면서(5'→3' 엑소) 채우는(5'→3' 중합) 일꾼"으로 기억하면 닉 트랜슬레이션 개념이 쉽게 이해돼요.
국시 빈출 포인트: DNA 복제는 약사 국가고시 생화학/분자생물학 영역에서 기본 중의 기본으로 출제됩니다. 각 효소의 이름, 작용 방향(특히 5'→3'), 그리고 원핵세포와 진핵세포의 차이점을 표로 정리해 두면 유사 문제에 강해집니다.
기출 변형 주의!: "만약 DNA 중합효소 I의 5'→3' 엑소뉴클레아제 활성이 없는 돌연변이 대장균이 있다면, 어떤 현상이 관찰될까요?"와 같은 형태로도 변형될 수 있습니다. (오카자키 절편 사이에 RNA가 남아 불완전한 DNA가 생성됨)