다음은 동일한 세균 균주에서 분리한 두 플라스미드(A, B)를 제한효소 EcoRI로 절단한 후 전기영동한 결과이다. 이 결과를 해석하여 플라스미드 A와 B의 구조에 대한 설명으로 옳은 것은?

원형 플라스미드를 제한효소로 절단하면 절단 부위 수만큼의 선형 단편이 생성된다. 플라스미드 A를 EcoRI로 절단하면 4.0 kb와 2.0 kb 두 단편이 나오므로, EcoRI 절단 부위가 2개이고 총 크기는 4.0 + 2.0 = 6.0 kb이다. 플라스미드 B를 EcoRI로 절단하면 6.0 kb 단편 1개만 나오므로, EcoRI 절단 부위가 1개이면 선형화되어 하나의 밴드가 나오거나, 절단 부위가 없으면 초나선형 그대로 이동하여 비절단 대조군과 동일한 위치에 밴드가 나타난다. 문제에서 비절단 플라스미드 B는 초나선형으로 이동하는데, 절단 후 6.0 kb 선형 밴드가 나타난다면 이는 EcoRI 부위가 1개 있는 경우이다. 그러나 선택지 3에서 플라스미드 B에 EcoRI 절단 부위가 없다고 하면 절단 후에도 초나선형으로 이동해야 하며, 이 경우 6.0 kb 선형 표준 마커 위치와는 다른 위치에 밴드가 나타날 수 있다. 실제로 문제 자료에서 비절단 상태의 밴드와 절단 후 밴드 위치가 다르게 제시되었다면 절단이 일어난 것이고, 절단 부위가 1개인 경우 6.0 kb 선형 단편 1개가 생성된다. 그러나 선택지 1과 3의 차이는 플라스미드 B의 절단 부위 수(1개 vs. 없음)이다. 만약 EcoRI 절단 부위가 없다면 효소 처리 후에도 초나선형 밴드만 보이고 선형 6.0 kb 밴드는 나오지 않아야 하므로, 제시된 자료("EcoRI 절단 후 6.0 kb 밴드")는 절단이 일어났음을 의미한다. 따라서 플라스미드 B에는 EcoRI 절단 부위가 1개 있고 총 크기가 6.0 kb이다. 이에 해당하는 선택지는 1번이다. 단, 선택지 1과 3을 다시 비교하면, 선택지 3은 "플라스미드 B에 EcoRI 절단 부위가 없다"고 하므로 절단 후 선형 밴드가 나올 수 없어 자료와 모순된다. 선택지 1이 올바른 해석이다. ※ 출제 의도에 따라 정답을 1번으로 정정합니다.