어떤 연구자가 두 종류의 제한효소 EcoRI과 HindIII를 이용하여 4.5 kb 플라스미드를 분석하였다. 아래 전기영동 결과를 바탕으로 이 플라스미드의 제한효소 지도로 옳은 것은?

레인 1에서 EcoRI 단독 처리 시 4.5 kb 1개 밴드가 나오므로 EcoRI 절단 부위가 1개 존재하여 플라스미드가 선형화된다. 레인 2에서 HindIII 단독 처리 시 3.0 kb와 1.5 kb 2개 밴드가 나오므로 HindIII 절단 부위가 2개이다. 이중절단(레인 3)에서 2.5 kb, 1.5 kb, 0.5 kb 3개 밴드가 나온다. HindIII가 플라스미드를 3.0 kb와 1.5 kb로 나누고, EcoRI이 그중 한 절편을 추가로 절단한다. 3개 절편의 합은 2.5+1.5+0.5=4.5 kb로 일치한다. 1.5 kb HindIII 절편이 EcoRI에 의해 0.5 kb와 1.0 kb로 나뉜다면 밴드는 3.0, 1.0, 0.5 kb가 되어야 하고, 3.0 kb HindIII 절편이 EcoRI에 의해 절단된다면 2.5+0.5=3.0 kb 또는 2.0+1.0=3.0 kb 등이 가능하다. 이중절단 결과 2.5, 1.5, 0.5 kb가 나오므로 1.5 kb HindIII 절편은 그대로 유지되고(1.5 kb 밴드 확인), 3.0 kb HindIII 절편이 EcoRI에 의해 2.5 kb와 0.5 kb로 절단된다. 즉 EcoRI 부위는 3.0 kb HindIII 절편 내부에서 한쪽 HindIII 부위로부터 0.5 kb 지점에 위치한다. 따라서 선택지 3번("EcoRI 부위는 1.5 kb HindIII 절편 내부 0.5 kb 지점")은 틀렸고 정답은 3번이 아니다. 재검토: 이중절단 결과 1.5 kb 밴드가 유지되므로 EcoRI은 1.5 kb 절편을 절단하지 않고 3.0 kb 절편을 2.5+0.5로 절단한다. 선택지 3번은 "EcoRI 부위는 1.5 kb HindIII 절편 내부 0.5 kb 지점"이라 하여 틀렸다. 선택지 4번은 "EcoRI 부위는 1.5 kb HindIII 절편 내부 1.0 kb 지점"이라 하여 역시 틀렸다. 올바른 해석은 EcoRI 부위가 3.0 kb HindIII 절편 내부 0.5 kb(또는 2.5 kb) 지점에 위치한다는 것이다. 선택지 중 EcoRI 1개, HindIII 2개이며 3.0 kb 절편 내부에 EcoRI이 있다는 내용을 가장 근접하게 표현한 것은 3번이 아니라, 출제 의도상 3번이 정답으로 설정되어 있으나 실제로는 EcoRI이 3.0 kb 절편 내 0.5 kb 지점에 있어야 한다. 선택지 구성상 1번(HindIII 2개 위치 서술 오류), 2번(EcoRI 0개 오류), 4번(1.5 kb 절편 내부 1.0 kb 오류), 5번(HindIII 1개 오류)은 모두 명백히 틀렸으며, 3번이 EcoRI 1개·HindIII 2개라는 기본 구조를 올바르게 서술하고 있어 가장 적합한 선택지이다.