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UV : 공액 이중결합계 · 발색단. IR : 수산기 · 카보닐기 작용기. NMR : 탄소 · 수소 수 · 결합 관계. MS : 분자량 · 조각 이온
UV·IR·NMR·MS 병용 구조결정이 원칙이고, 고분해능 질량분석과 분자식 결정 : 정밀질량으로 확정
2D-NMR(COSY, HSQC, HMBC, NOESY) : COSY 인접 수소 스핀결합 · HSQC 직접 결합 탄소-수소 · HMBC 두세 결합 원거리 상관으로 골격 연결 · NOESY 공간 근접 수소로 상대배치
선광도는 편광면 회전 방향과 크기를 나타내고, CD/ORD에 의한 절대배치 결정은 원편광 흡수 차를 이용한다.
X선 결정구조 해석은 단결정이 있으면 절대배치까지 확정적이며, 화학적 유도체화 · 분해반응에 의한 구조 확인이 보조한다.
아세테이트-말로네이트 경로(폴리케타이드, 안트라퀴논) : 아세틸조효소A에 말로닐 반복 축합 · 고리화하면 안트라퀴논 · 환원되면 지방산 · 동위원소 표지 전구체 추적으로 입증
메발론산/MEP 경로(모노 · 세스퀴 · 디 · 트리테르펜, 스테로이드) : 메발론산은 세포질 · MEP는 색소체 · 전구체 이소펜테닐이인산 · 모노 C10 · 세스퀴 C15 · 디 C20 · 트리 C30
정유 주성분은 모노·세스퀴테르펜이며 탄소 수가 적을수록 휘발성이 증가한다.
시킴산 경로(페닐프로파노이드, 쿠마린, 리그난, 플라보노이드)는 방향족 아미노산을 거치며, 아세테이트가 함께 참여하면 혼합 생합성 경로다.
아미노산 유래 알칼로이드 생합성 : 오르니틴 · 라이신 · 트립토판 · 티로신이 질소 공급원
| 경로 | 주요 전구체 | 대표 산물 |
|---|---|---|
| 아세테이트-말로네이트 | 아세틸CoA와 말로닐CoA | 폴리케타이드, 안트라퀴논 |
| 메발론산/MEP | 이소펜테닐이인산 | 테르펜, 스테로이드 |
| 시킴산 | 방향족 아미노산 | 페닐프로파노이드, 쿠마린 |
| 혼합 경로 | 시킴산과 아세테이트 | 플라보노이드 |
| 아미노산 경로 | 오르니틴, 트립토판 | 알칼로이드 |
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