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[약품생화학]
표준 20종 아미노산 분류(비극성 · 극성 · 산성 · 염기성) · 비극성은 소수성 상호작용으로 내부에 묻힘
필수아미노산 9종 : 히스티딘 · 아이소류신 · 류신 · 라이신 · 메싸이오닌 · 페닐알라닌 · 트레오닌 · 트립토판 · 발린 · 체내 합성 불가
등전점(pI)과 완충작용 : 알짜전하 0인 pH · pI보다 낮으면 양전하, 높으면 음전하 · 완충은 pKa 부근 최대 · 히스티딘(pKa 6) 기여
펩타이드결합의 부분이중결합성 : 공명으로 회전 억제 · 여섯 원자 한 평면 · 대개 트랜스
라마찬드란 도표 : 파이·프사이 허용 조합 · 밀집 영역은 α-나선과 β-병풍 · 글리신이 가장 넓음
1~4차 구조와 소단위체 : 1차 서열 · 2차 국소 규칙구조 · 3차 입체배치 · 4차 회합
α-나선/β-병풍/β-회전 : α-나선은 3.6잔기/회전에 i와 i+4 수소결합 · 3차는 소수성 상호작용이 추진력, 이황화결합이 고정
단백질 폴딩과 샤페론 : 자유에너지 감소 방향 · 1차 구조가 최종 구조 결정 · 샤페론이 소수성 표면을 가려 응집 억제
접힘에 실패한 사슬이 쌓이면 아밀로이드 misfolding 침착이 생긴다.
| 단계 | 정의 | 주된 결합력 |
|---|---|---|
| 1차 | 아미노산 서열 | 펩타이드결합 |
| 2차 | α-나선, β-병풍, β-회전 | 수소결합 |
| 3차 | 사슬 하나의 입체 배치 | 소수성 상호작용, 이황화결합 |
| 4차 | 소단위체 회합 | 비공유 상호작용 |
헤모글로빈 협동결합과 S자형 산소해리곡선 : 4소단위체 · T→R 전환으로 친화도 증가 · 미오글로빈은 쌍곡선
2,3-BPG는 T상태에 결합해 산소친화도를 감소시켜 고지대에서 증가하고, Bohr 효과는 CO2 증가와 pH 감소로 조직 산소 방출을 늘린다.
콜라겐 삼중나선과 수산화프롤린 : 세 잔기마다 글리신 반복 · 수산화는 비타민 C 의존 · 결핍 시 출혈과 상처 치유 지연
| 구분 | 헤모글로빈 | 미오글로빈 |
|---|---|---|
| 구조 | 4량체 소단위체 | 단량체 |
| 곡선 | S자형 | 쌍곡선 |
| 협동결합 | 있음 | 없음 |
| 2,3-BPG | 친화도 감소 | 영향 없음 |
| Bohr 효과 | 뚜렷함 | 미미함 |
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